南京审计学院图书馆现由浦口馆和莫愁分馆组成,馆舍总建筑面积达35257平方米,共有阅览座位3568个,馆舍布局合理,功能完善,设施先进,无线网络覆盖全馆,除了传统阅览室外,还专门设有水榭交流区、学术研讨室、研究生导师工作室、博士沙龙、素质教育区等;设有办公室、信息咨询部、采编部、技术保障部、读者服务部和莫愁分馆等机构。南京审计学院图书馆馆藏资源丰富,拥有各类图书140万册,电子图书310万种,中文电子期刊9000余种,外文电子期刊3000余种,中文数据库26个,外文数据库9个,存储资源容量达70TB;订购中外文期刊1714种,中外文报纸157种。